Được thành lập từ năm 1992, Khoa Đào tạo sau đại học Trường Đại học Mở TP.HCM tổ chức đào tạo các chương trình thạc sĩ và tiến sĩ trong nước và liên kết ở ba lĩnh vực chính: kinh tế - quản trị, kỹ thuật - công nghệ, và xã hội - nhân văn. Khoa hiện có trên 1200 học viên đang theo học các chương trình thạc sĩ trong nước, trên 300 học viên đang theo học các chương trình liên kết và 45 nghiên cứu sinh đang theo học các chương trình tiến sĩ.

Khoa Đào tạo sau đại học đã dần khẳng định vị thế như là nơi đào tạo học thuật nghiêm túc và minh bạch, chú ý tổ chức hỗ trợ học tập đến từng cá nhân và cung cấp được các loại hình đào tạo đa dạng và linh hoạt. Chương trình đào tạo được xây dựng với các môn học và nội dung giảng dạy theo chuẩn quốc tế do lực lượng giảng viên trong và ngoài nước đảm nhiệm. Nghiên cứu ứng dụng được chú ý phát triển và Khoa tổ chức thường xuyên hội thảo trong nước và quốc tế để học viên tham gia viết bài, trình bày kết quả nghiên cứu tạo điều kiện nhanh chóng tiếp cận và chia sẻ kết quả nghiên cứu trong lĩnh vực mình.